Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM27P14373 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms