Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
XRCC5P13010 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms