Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LYL1P12980 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LYL1P12980 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LYL1P12980 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LYL1P12980 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms