Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCF2P10911 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCF2P10911 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCF2P10911 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCF2P10911 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCF2P10911 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCF2P10911 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCF2P10911 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCF2P10911 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MCF2P10911 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCF2P10911 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MCF2P10911 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCF2P10911 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MCF2P10911 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCF2P10911 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MCF2P10911 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MCF2P10911 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCF2P10911 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCF2P10911 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCF2P10911 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCF2P10911 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCF2P10911 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCF2P10911 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCF2P10911 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCF2P10911 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCF2P10911 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCF2P10911 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCF2P10911 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCF2P10911 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCF2P10911 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCF2P10911 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCF2P10911 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCF2P10911 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCF2P10911 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCF2P10911 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCF2P10911 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCF2P10911 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCF2P10911 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCF2P10911 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCF2P10911 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCF2P10911 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCF2P10911 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCF2P10911 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCF2P10911 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCF2P10911 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCF2P10911 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCF2P10911 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCF2P10911 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCF2P10911 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCF2P10911 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCF2P10911 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCF2P10911 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCF2P10911 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCF2P10911 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCF2P10911 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCF2P10911 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCF2P10911 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCF2P10911 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCF2P10911 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCF2P10911 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MCF2P10911 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCF2P10911 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCF2P10911 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCF2P10911 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MCF2P10911 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCF2P10911 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCF2P10911 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCF2P10911 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCF2P10911 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MCF2P10911 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
MCF2P10911 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCF2P10911 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCF2P10911 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCF2P10911 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCF2P10911 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCF2P10911 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCF2P10911 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCF2P10911 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCF2P10911 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MCF2P10911 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCF2P10911 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCF2P10911 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCF2P10911 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCF2P10911 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCF2P10911 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MCF2P10911 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCF2P10911 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCF2P10911 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCF2P10911 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCF2P10911 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCF2P10911 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCF2P10911 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCF2P10911 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCF2P10911 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCF2P10911 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCF2P10911 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCF2P10911 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCF2P10911 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCF2P10911 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCF2P10911 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms