Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSIG8P0DPA2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSIG8P0DPA2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms