Protein–RNA interactions for Protein: P0DP23

CALM1, Calmodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM1P0DP23 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CALM1P0DP23 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALM1P0DP23 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALM1P0DP23 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALM1P0DP23 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALM1P0DP23 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALM1P0DP23 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALM1P0DP23 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALM1P0DP23 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALM1P0DP23 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALM1P0DP23 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALM1P0DP23 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALM1P0DP23 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CALM1P0DP23 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms