Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFTA3P0C7M3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms