Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC175P0C221 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms