Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIL1P09327 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIL1P09327 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIL1P09327 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIL1P09327 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIL1P09327 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIL1P09327 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VIL1P09327 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIL1P09327 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIL1P09327 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIL1P09327 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIL1P09327 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIL1P09327 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIL1P09327 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VIL1P09327 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VIL1P09327 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIL1P09327 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VIL1P09327 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIL1P09327 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIL1P09327 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIL1P09327 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIL1P09327 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIL1P09327 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIL1P09327 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIL1P09327 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIL1P09327 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIL1P09327 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIL1P09327 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIL1P09327 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIL1P09327 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIL1P09327 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIL1P09327 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIL1P09327 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIL1P09327 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIL1P09327 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIL1P09327 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIL1P09327 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIL1P09327 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIL1P09327 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VIL1P09327 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIL1P09327 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIL1P09327 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIL1P09327 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIL1P09327 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIL1P09327 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIL1P09327 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VIL1P09327 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIL1P09327 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIL1P09327 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VIL1P09327 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIL1P09327 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIL1P09327 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VIL1P09327 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIL1P09327 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIL1P09327 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIL1P09327 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIL1P09327 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIL1P09327 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIL1P09327 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIL1P09327 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIL1P09327 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIL1P09327 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIL1P09327 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIL1P09327 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIL1P09327 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VIL1P09327 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIL1P09327 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIL1P09327 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIL1P09327 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIL1P09327 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIL1P09327 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIL1P09327 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VIL1P09327 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VIL1P09327 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIL1P09327 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIL1P09327 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIL1P09327 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIL1P09327 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIL1P09327 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIL1P09327 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIL1P09327 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIL1P09327 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIL1P09327 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIL1P09327 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIL1P09327 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIL1P09327 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIL1P09327 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIL1P09327 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIL1P09327 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIL1P09327 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIL1P09327 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIL1P09327 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIL1P09327 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIL1P09327 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIL1P09327 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIL1P09327 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIL1P09327 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIL1P09327 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIL1P09327 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIL1P09327 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms