Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACAA1P09110 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms