Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPBP07199 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPBP07199 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPBP07199 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPBP07199 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPBP07199 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPBP07199 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPBP07199 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPBP07199 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPBP07199 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPBP07199 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPBP07199 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPBP07199 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPBP07199 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPBP07199 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPBP07199 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPBP07199 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPBP07199 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPBP07199 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPBP07199 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPBP07199 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPBP07199 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPBP07199 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPBP07199 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPBP07199 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPBP07199 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPBP07199 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPBP07199 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPBP07199 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPBP07199 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPBP07199 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPBP07199 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPBP07199 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPBP07199 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPBP07199 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPBP07199 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPBP07199 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPBP07199 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPBP07199 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPBP07199 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPBP07199 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPBP07199 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPBP07199 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPBP07199 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPBP07199 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPBP07199 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPBP07199 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPBP07199 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPBP07199 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPBP07199 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPBP07199 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPBP07199 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPBP07199 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPBP07199 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPBP07199 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPBP07199 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPBP07199 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPBP07199 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPBP07199 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPBP07199 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPBP07199 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPBP07199 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPBP07199 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPBP07199 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPBP07199 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPBP07199 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPBP07199 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPBP07199 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPBP07199 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPBP07199 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPBP07199 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPBP07199 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPBP07199 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPBP07199 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPBP07199 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPBP07199 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPBP07199 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPBP07199 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPBP07199 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPBP07199 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CENPBP07199 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CENPBP07199 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CENPBP07199 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPBP07199 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPBP07199 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPBP07199 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPBP07199 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPBP07199 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPBP07199 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPBP07199 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPBP07199 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPBP07199 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPBP07199 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPBP07199 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPBP07199 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPBP07199 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPBP07199 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPBP07199 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPBP07199 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPBP07199 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms