Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEFMP07197 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NEFMP07197 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NEFMP07197 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NEFMP07197 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NEFMP07197 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFMP07197 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFMP07197 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFMP07197 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFMP07197 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFMP07197 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFMP07197 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFMP07197 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFMP07197 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFMP07197 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFMP07197 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFMP07197 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFMP07197 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFMP07197 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFMP07197 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFMP07197 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFMP07197 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFMP07197 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFMP07197 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFMP07197 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFMP07197 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEFMP07197 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFMP07197 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFMP07197 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFMP07197 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFMP07197 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFMP07197 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFMP07197 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFMP07197 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFMP07197 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFMP07197 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFMP07197 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFMP07197 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFMP07197 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFMP07197 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFMP07197 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFMP07197 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFMP07197 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEFMP07197 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFMP07197 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFMP07197 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFMP07197 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFMP07197 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFMP07197 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFMP07197 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFMP07197 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFMP07197 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFMP07197 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFMP07197 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFMP07197 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFMP07197 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFMP07197 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFMP07197 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFMP07197 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFMP07197 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFMP07197 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFMP07197 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFMP07197 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFMP07197 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFMP07197 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFMP07197 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFMP07197 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEFMP07197 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFMP07197 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFMP07197 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFMP07197 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFMP07197 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFMP07197 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFMP07197 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFMP07197 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFMP07197 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFMP07197 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFMP07197 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFMP07197 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFMP07197 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFMP07197 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFMP07197 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFMP07197 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFMP07197 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFMP07197 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFMP07197 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFMP07197 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFMP07197 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFMP07197 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFMP07197 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NEFMP07197 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFMP07197 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEFMP07197 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms