Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX7O95931 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX7O95931 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX7O95931 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX7O95931 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX7O95931 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX7O95931 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX7O95931 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX7O95931 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX7O95931 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX7O95931 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX7O95931 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX7O95931 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX7O95931 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX7O95931 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX7O95931 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX7O95931 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX7O95931 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX7O95931 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX7O95931 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX7O95931 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CBX7O95931 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms