Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYF2O95926 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYF2O95926 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYF2O95926 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYF2O95926 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYF2O95926 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYF2O95926 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYF2O95926 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYF2O95926 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SYF2O95926 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SYF2O95926 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SYF2O95926 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SYF2O95926 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYF2O95926 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SYF2O95926 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYF2O95926 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYF2O95926 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYF2O95926 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYF2O95926 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYF2O95926 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYF2O95926 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYF2O95926 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYF2O95926 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SYF2O95926 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYF2O95926 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYF2O95926 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYF2O95926 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYF2O95926 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYF2O95926 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYF2O95926 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYF2O95926 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYF2O95926 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYF2O95926 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SYF2O95926 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYF2O95926 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYF2O95926 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYF2O95926 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYF2O95926 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYF2O95926 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYF2O95926 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SYF2O95926 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYF2O95926 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYF2O95926 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYF2O95926 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYF2O95926 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYF2O95926 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYF2O95926 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SYF2O95926 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYF2O95926 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYF2O95926 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYF2O95926 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYF2O95926 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYF2O95926 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYF2O95926 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYF2O95926 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYF2O95926 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYF2O95926 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYF2O95926 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYF2O95926 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYF2O95926 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYF2O95926 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYF2O95926 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYF2O95926 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYF2O95926 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms