Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD1O95696 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD1O95696 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD1O95696 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD1O95696 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD1O95696 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD1O95696 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD1O95696 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD1O95696 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD1O95696 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD1O95696 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BRD1O95696 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD1O95696 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD1O95696 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD1O95696 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms