Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DYSFO75923 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DYSFO75923 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DYSFO75923 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DYSFO75923 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DYSFO75923 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DYSFO75923 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DYSFO75923 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DYSFO75923 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DYSFO75923 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DYSFO75923 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DYSFO75923 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DYSFO75923 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DYSFO75923 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DYSFO75923 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DYSFO75923 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DYSFO75923 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DYSFO75923 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DYSFO75923 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DYSFO75923 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DYSFO75923 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DYSFO75923 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DYSFO75923 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DYSFO75923 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DYSFO75923 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DYSFO75923 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DYSFO75923 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DYSFO75923 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
DYSFO75923 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
DYSFO75923 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DYSFO75923 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
DYSFO75923 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DYSFO75923 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DYSFO75923 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DYSFO75923 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DYSFO75923 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DYSFO75923 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DYSFO75923 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DYSFO75923 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DYSFO75923 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DYSFO75923 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DYSFO75923 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DYSFO75923 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DYSFO75923 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DYSFO75923 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DYSFO75923 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DYSFO75923 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DYSFO75923 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DYSFO75923 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms