Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX3O75364 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX3O75364 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX3O75364 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX3O75364 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms