Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP2O75323 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms