Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP9AO75110 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP9AO75110 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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