Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DTNBO60941 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DTNBO60941 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DTNBO60941 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DTNBO60941 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DTNBO60941 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DTNBO60941 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DTNBO60941 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DTNBO60941 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DTNBO60941 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DTNBO60941 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DTNBO60941 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DTNBO60941 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DTNBO60941 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DTNBO60941 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DTNBO60941 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DTNBO60941 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DTNBO60941 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DTNBO60941 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DTNBO60941 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DTNBO60941 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DTNBO60941 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DTNBO60941 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DTNBO60941 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DTNBO60941 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DTNBO60941 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DTNBO60941 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DTNBO60941 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DTNBO60941 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DTNBO60941 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DTNBO60941 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DTNBO60941 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DTNBO60941 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DTNBO60941 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTNBO60941 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTNBO60941 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTNBO60941 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTNBO60941 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTNBO60941 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTNBO60941 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTNBO60941 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTNBO60941 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTNBO60941 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTNBO60941 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTNBO60941 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTNBO60941 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTNBO60941 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTNBO60941 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTNBO60941 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTNBO60941 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTNBO60941 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTNBO60941 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTNBO60941 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTNBO60941 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTNBO60941 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTNBO60941 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DTNBO60941 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DTNBO60941 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DTNBO60941 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DTNBO60941 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DTNBO60941 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DTNBO60941 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DTNBO60941 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DTNBO60941 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DTNBO60941 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DTNBO60941 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DTNBO60941 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DTNBO60941 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DTNBO60941 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DTNBO60941 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DTNBO60941 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DTNBO60941 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DTNBO60941 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DTNBO60941 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DTNBO60941 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DTNBO60941 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DTNBO60941 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DTNBO60941 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DTNBO60941 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DTNBO60941 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTNBO60941 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTNBO60941 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTNBO60941 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTNBO60941 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTNBO60941 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTNBO60941 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTNBO60941 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTNBO60941 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTNBO60941 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTNBO60941 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTNBO60941 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTNBO60941 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTNBO60941 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTNBO60941 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTNBO60941 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTNBO60941 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTNBO60941 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTNBO60941 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTNBO60941 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTNBO60941 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms