Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH6O60337 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH6O60337 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms