Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA2O43921 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms