Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTN4O43707 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN4O43707 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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