Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DENRO43583 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DENRO43583 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DENRO43583 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DENRO43583 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DENRO43583 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DENRO43583 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DENRO43583 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DENRO43583 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DENRO43583 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DENRO43583 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DENRO43583 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DENRO43583 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DENRO43583 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DENRO43583 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DENRO43583 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DENRO43583 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DENRO43583 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DENRO43583 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DENRO43583 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DENRO43583 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DENRO43583 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DENRO43583 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DENRO43583 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DENRO43583 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DENRO43583 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DENRO43583 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DENRO43583 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DENRO43583 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DENRO43583 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DENRO43583 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DENRO43583 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DENRO43583 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DENRO43583 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DENRO43583 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DENRO43583 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms