Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNQ2O43526 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms