Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms