Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM2O43147 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM2O43147 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM2O43147 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM2O43147 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM2O43147 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM2O43147 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM2O43147 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM2O43147 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM2O43147 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM2O43147 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM2O43147 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM2O43147 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM2O43147 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM2O43147 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGSM2O43147 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGSM2O43147 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM2O43147 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms