Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEFVO15553 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEFVO15553 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEFVO15553 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEFVO15553 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEFVO15553 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEFVO15553 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEFVO15553 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEFVO15553 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MEFVO15553 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEFVO15553 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEFVO15553 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEFVO15553 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEFVO15553 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEFVO15553 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEFVO15553 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEFVO15553 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEFVO15553 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEFVO15553 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEFVO15553 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEFVO15553 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MEFVO15553 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEFVO15553 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEFVO15553 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEFVO15553 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MEFVO15553 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEFVO15553 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEFVO15553 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEFVO15553 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEFVO15553 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEFVO15553 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MEFVO15553 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEFVO15553 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEFVO15553 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MEFVO15553 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEFVO15553 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEFVO15553 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEFVO15553 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEFVO15553 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEFVO15553 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEFVO15553 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEFVO15553 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEFVO15553 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEFVO15553 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEFVO15553 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEFVO15553 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEFVO15553 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEFVO15553 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEFVO15553 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEFVO15553 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEFVO15553 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEFVO15553 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEFVO15553 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEFVO15553 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEFVO15553 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEFVO15553 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEFVO15553 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEFVO15553 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEFVO15553 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEFVO15553 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEFVO15553 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEFVO15553 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEFVO15553 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MEFVO15553 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEFVO15553 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEFVO15553 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEFVO15553 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEFVO15553 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEFVO15553 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEFVO15553 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEFVO15553 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEFVO15553 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEFVO15553 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEFVO15553 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEFVO15553 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEFVO15553 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEFVO15553 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MEFVO15553 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEFVO15553 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEFVO15553 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEFVO15553 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEFVO15553 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEFVO15553 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEFVO15553 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEFVO15553 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEFVO15553 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MEFVO15553 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEFVO15553 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEFVO15553 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEFVO15553 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEFVO15553 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEFVO15553 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEFVO15553 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms