Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF6O14896 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF6O14896 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF6O14896 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF6O14896 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF6O14896 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF6O14896 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF6O14896 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF6O14896 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF6O14896 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF6O14896 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF6O14896 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF6O14896 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF6O14896 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF6O14896 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF6O14896 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF6O14896 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF6O14896 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF6O14896 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF6O14896 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF6O14896 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF6O14896 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF6O14896 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IRF6O14896 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IRF6O14896 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF6O14896 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF6O14896 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF6O14896 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF6O14896 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF6O14896 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF6O14896 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF6O14896 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF6O14896 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF6O14896 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF6O14896 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF6O14896 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF6O14896 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF6O14896 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF6O14896 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF6O14896 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF6O14896 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF6O14896 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF6O14896 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF6O14896 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF6O14896 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF6O14896 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF6O14896 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF6O14896 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF6O14896 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF6O14896 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF6O14896 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF6O14896 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF6O14896 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF6O14896 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF6O14896 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF6O14896 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF6O14896 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF6O14896 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF6O14896 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF6O14896 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF6O14896 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF6O14896 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF6O14896 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF6O14896 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF6O14896 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF6O14896 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF6O14896 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF6O14896 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF6O14896 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF6O14896 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF6O14896 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF6O14896 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF6O14896 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF6O14896 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF6O14896 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF6O14896 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF6O14896 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF6O14896 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF6O14896 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF6O14896 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF6O14896 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF6O14896 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF6O14896 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF6O14896 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF6O14896 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF6O14896 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF6O14896 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF6O14896 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF6O14896 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF6O14896 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF6O14896 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF6O14896 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF6O14896 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF6O14896 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF6O14896 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF6O14896 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF6O14896 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF6O14896 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF6O14896 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF6O14896 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms