Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
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