Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
J3KT08 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
J3KT08 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
J3KT08 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms