Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BQV1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQV1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQV1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQV1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQV1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQV1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQV1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQV1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQV1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQV1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQV1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQV1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQV1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQV1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQV1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQV1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQV1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQV1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQV1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQV1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQV1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQV1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQV1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQV1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQV1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BQV1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BQV1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BQV1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms