Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COLCA2A8K830 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COLCA2A8K830 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COLCA2A8K830 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COLCA2A8K830 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COLCA2A8K830 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COLCA2A8K830 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COLCA2A8K830 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COLCA2A8K830 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COLCA2A8K830 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COLCA2A8K830 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COLCA2A8K830 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COLCA2A8K830 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COLCA2A8K830 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COLCA2A8K830 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COLCA2A8K830 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COLCA2A8K830 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COLCA2A8K830 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COLCA2A8K830 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COLCA2A8K830 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COLCA2A8K830 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COLCA2A8K830 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COLCA2A8K830 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COLCA2A8K830 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COLCA2A8K830 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COLCA2A8K830 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COLCA2A8K830 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COLCA2A8K830 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
COLCA2A8K830 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COLCA2A8K830 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COLCA2A8K830 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms