Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms