Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms