Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRI6

CENPVL3, Centromere protein V-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL3A0A0U1RRI6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPVL3A0A0U1RRI6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPVL3A0A0U1RRI6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms