Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 HHLA3-207ENST00000531950 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 OR7E161P-201ENST00000533722 967 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC068631.3-201ENST00000538831 225 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC006581.1-201ENST00000545706 496 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 UBE2Q2P11-201ENST00000559691 205 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 UBE2CP4-201ENST00000561405 535 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC110079.2-202ENST00000629093 698 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC107398.3-201ENST00000562284 7000 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 NEK10-201ENST00000295720 2871 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC145207.5-201ENST00000582866 2682 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 EIF4BP4-201ENST00000441847 1780 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC012513.3-201ENST00000623250 2116 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 NCR3LG1-201ENST00000338965 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ERC1-203ENST00000360905 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 DIS3L2-202ENST00000325385 3501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 MTRF1-202ENST00000379477 1948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ZNF320-201ENST00000391781 6074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 OR10G8-201ENST00000431524 1045 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 Z98752.2-201ENST00000432727 312 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AL137074.1-201ENST00000442640 465 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 GCNT1P5-201ENST00000449274 682 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
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MKRN3Q13064 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ZNF695-204ENST00000487338 826 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RN7SL635P-201ENST00000492123 296 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC083902.1-201ENST00000508578 359 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 IGKV3-34-201ENST00000521692 293 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 DNM1P33-201ENST00000565222 270 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
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MKRN3Q13064 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC9.1□□□□□ -0.95
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MKRN3Q13064 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RUNX1T1-203ENST00000396218 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 OR1D2-202ENST00000641064 4882 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 BBS4-201ENST00000268057 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 BTN2A1-201ENST00000312541 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 COPG1-201ENST00000314797 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 C11orf88-203ENST00000529167 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 PTP4A2-218ENST00000602725 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 UBQLN3-201ENST00000311659 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ZNF2-204ENST00000617923 3885 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 PTPRK-206ENST00000368215 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ZNF555-201ENST00000334241 8557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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