Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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CHD4Q14839 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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CHD4Q14839 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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CHD4Q14839 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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CHD4Q14839 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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CHD4Q14839 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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