Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MED12-203ENST00000374102 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 FN1-207ENST00000421182 8103 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 POLDIP3-203ENST00000348657 3323 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SNRNP48-201ENST00000342415 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 COL14A1-201ENST00000247781 3450 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ANP32E-208ENST00000583931 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 OC90-201ENST00000254627 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PLEKHG4-204ENST00000427155 4455 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPN4-201ENST00000263708 10300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF148-207ENST00000492394 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PRKCH-211ENST00000555082 2932 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 WARS-202ENST00000355338 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZMYND8-202ENST00000311275 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PKP1-202ENST00000352845 2244 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 NRXN3-218ENST00000635466 5254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TP53BP1-210ENST00000450115 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PPP3CB-204ENST00000394829 3149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA0753-207ENST00000572370 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AP000552.1-202ENST00000436681 3714 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPRK-221ENST00000532331 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SGK1-201ENST00000237305 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AGPAT4-203ENST00000366911 7705 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PDIK1L-201ENST00000374269 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01358-207ENST00000634502 2575 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SUSD4-207ENST00000484758 2736 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ATL1-202ENST00000441560 2853 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC13A2-202ENST00000444914 2855 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 GRID1-201ENST00000327946 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 HNRNPA1L2-201ENST00000357495 3011 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SOX9-AS1-204ENST00000434703 3032 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01018-201ENST00000505626 3036 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF556-201ENST00000307635 6574 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CAP2-201ENST00000229922 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TACC2-229ENST00000515603 9101 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SYNJ2-201ENST00000355585 7378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 DRC1-201ENST00000288710 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AHCYP5-201ENST00000331585 1238 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PARP1-201ENST00000366790 570 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RBMX2-202ENST00000370947 798 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TRIM32-201ENST00000373983 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TRBV11-1-201ENST00000390367 364 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 VENTXP2-201ENST00000399480 481 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms