Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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IFT88Q13099 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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IFT88Q13099 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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IFT88Q13099 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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IFT88Q13099 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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