Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
USF2Q15853 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
USF2Q15853 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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