Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
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VPS72Q15906 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
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VPS72Q15906 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
VPS72Q15906 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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