Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTPAP49638 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTPAP49638 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTPAP49638 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTPAP49638 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTPAP49638 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTPAP49638 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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TTPAP49638 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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TTPAP49638 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTPAP49638 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTPAP49638 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTPAP49638 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTPAP49638 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTPAP49638 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTPAP49638 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTPAP49638 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTPAP49638 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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TTPAP49638 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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TTPAP49638 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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TTPAP49638 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTPAP49638 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTPAP49638 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTPAP49638 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTPAP49638 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTPAP49638 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTPAP49638 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTPAP49638 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTPAP49638 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTPAP49638 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTPAP49638 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTPAP49638 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTPAP49638 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTPAP49638 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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