Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
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CCDC88CQ9P219 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CCDC88CQ9P219 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCDC88CQ9P219 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCDC88CQ9P219 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCDC88CQ9P219 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCDC88CQ9P219 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCDC88CQ9P219 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCDC88CQ9P219 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCDC88CQ9P219 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCDC88CQ9P219 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCDC88CQ9P219 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CCDC88CQ9P219 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCDC88CQ9P219 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCDC88CQ9P219 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCDC88CQ9P219 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCDC88CQ9P219 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCDC88CQ9P219 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCDC88CQ9P219 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
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CCDC88CQ9P219 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
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CCDC88CQ9P219 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCDC88CQ9P219 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCDC88CQ9P219 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
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CCDC88CQ9P219 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCDC88CQ9P219 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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CCDC88CQ9P219 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCDC88CQ9P219 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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CCDC88CQ9P219 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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CCDC88CQ9P219 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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CCDC88CQ9P219 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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CCDC88CQ9P219 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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CCDC88CQ9P219 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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CCDC88CQ9P219 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC88CQ9P219 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC88CQ9P219 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC88CQ9P219 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC88CQ9P219 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC88CQ9P219 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC88CQ9P219 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC88CQ9P219 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC88CQ9P219 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC88CQ9P219 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC88CQ9P219 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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