Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
TRIP13Q15645 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIP13Q15645 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIP13Q15645 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIP13Q15645 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIP13Q15645 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIP13Q15645 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIP13Q15645 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIP13Q15645 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIP13Q15645 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIP13Q15645 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRIP13Q15645 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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