Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 TTC33-207ENST00000637375 1824 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ADAM7-203ENST00000441335 1417 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms