Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC88CQ9P219 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms