Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 AC069499.2-201ENST00000610665 382 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 AL354740.1-202ENST00000612837 290 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 BUB1-212ENST00000535254 3576 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 LPA-202ENST00000447678 1839 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 MRPS33-201ENST00000324787 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 HSPA8P16-201ENST00000454171 1865 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 SBNO1-203ENST00000602398 4313 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 RUBCNL-206ENST00000409879 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 TRIM49D1-202ENST00000530311 2164 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 SLC39A9-202ENST00000336643 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 SMIM7-208ENST00000487416 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 SLFN13-210ENST00000534689 3058 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 LDB2-201ENST00000304523 2548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 CCDC62-203ENST00000392440 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 NEK6-204ENST00000373603 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 RAD17-219ENST00000521422 2323 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 LINC02204-201ENST00000630447 3206 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 PDZK1-201ENST00000344770 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 NAALAD2-210ENST00000534061 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 RAP2C-205ENST00000620646 3341 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 BPNT1-205ENST00000469520 2737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 TBC1D3P1-DHX40P1-201ENST00000587125 1841 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 ANO2-201ENST00000327087 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 TROVE2-204ENST00000367445 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 ALDH1L2-201ENST00000258494 7547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 FBXO36-201ENST00000283946 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 GRB10-204ENST00000398812 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 DNAJC6-202ENST00000371069 5365 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 AL353795.3-201ENST00000624351 5702 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 AC009967.1-201ENST00000379462 793 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 MAP3K7CL-205ENST00000399926 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 LINC01238-201ENST00000416204 590 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 AC002367.1-201ENST00000416765 405 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 GAPDHP68-201ENST00000434621 1008 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 AL592114.3-201ENST00000437919 446 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 CTLA4-204ENST00000472206 277 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 RPS28P7-201ENST00000473748 210 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 RN7SL507P-201ENST00000474076 296 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 IGHVII-1-1-201ENST00000517907 180 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 AC131025.1-201ENST00000521756 588 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 GSG1-206ENST00000537302 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 AC023908.2-201ENST00000558616 318 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 AC012414.3-201ENST00000559621 748 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 LINC00595-215ENST00000635422 651 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 AC078776.2-201ENST00000641021 285 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 GNL3LP1-201ENST00000399458 1643 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 EYA1-201ENST00000303824 3930 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 RBFOX1-201ENST00000311745 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 HTR4-202ENST00000362016 2979 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 AP3M1-202ENST00000372745 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 CDRT1-203ENST00000395667 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 RSRC1-203ENST00000464171 2411 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 FCRL4-201ENST00000271532 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 LINC01940-201ENST00000455228 3489 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 GTF3C2-202ENST00000359541 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 AC009403.2-202ENST00000636307 3956 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 APOL2-202ENST00000358502 2551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 FAT3-206ENST00000533797 7894 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 ZNF322-208ENST00000622479 4882 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 AL008721.2-201ENST00000609475 3754 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 HPSE2-203ENST00000370552 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 THAP12P7-201ENST00000520248 2290 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 OXNAD1-207ENST00000606098 2288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 DHX9-201ENST00000367549 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 AC008739.5-201ENST00000623035 1938 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 ZNF157-201ENST00000377073 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 ZNF155-209ENST00000611002 2732 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 CCDC144B-201ENST00000285176 4310 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 MAPK10-382ENST00000642023 2369 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 CEP152-202ENST00000380950 5635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 EGFLAM-201ENST00000322350 4411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 SCNM1-202ENST00000368905 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 SPATA13-206ENST00000424834 8603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 TNC-210ENST00000535648 7508 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 RSL1D1-204ENST00000571133 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 GIGYF2-203ENST00000409451 5937 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 AC211476.4-201ENST00000275546 699 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 OR7G3-201ENST00000305444 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 MRPL55-216ENST00000366744 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 YWHAZP3-201ENST00000415292 738 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CACNB1Q02641 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms