Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNX13Q9Y5W8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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SNX13Q9Y5W8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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SNX13Q9Y5W8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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SNX13Q9Y5W8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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SNX13Q9Y5W8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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