Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
UTP11Q9Y3A2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.9 ms